福建省农科院:首次破译大黄鱼锥体虫全基因组 为百亿大黄鱼产业绘就"病原说明书"
重大科研突破,为百亿产业提供病原基因组,信息增量大,但时效性稍差。
福建省农科院农业质量标准与检测技术研究所罗士炎研究员团队首次破译大黄鱼锥体虫基因组,整合PacBio HiFi高精度长读长测序、Hi-C染色质构象捕获技术开展全基因组解析,并开展跨物种比较基因组学分析,在锥体虫属系统演化中甄别到515个显著扩张基因家族。该基因组将作为"病原说明书"用于筛选特异性诊断标志物、开发分子检测方法、追踪病原遗传变化以及寻找药物作用靶点。
为破解产业发展瓶颈,研究团队整合PacBio HiFi高精度长读长测序、Hi-C染色质构象捕获前沿技术,系统开展大黄鱼锥体虫全基因组解析。
依托完整基因组数据,团队开展跨物种比较基因组学解析,厘清大黄鱼锥体虫在锥体虫属的系统演化地位,甄别得到515个显著扩张基因家族。功能富集分析表明,扩张基因集中作用于病原与宿主互作、免疫逃逸、物质代谢、细胞信号传导等关键通路,为揭示寄生虫适应海水养殖环境、诱发鱼类病害的内在分子机制提供关键理论依据。
“对大黄鱼产业而言,这份基因组就像一本可持续使用的‘病原说明书’。”罗士炎说,有了完整的遗传坐标,科研人员今后可更准确地筛选特异性诊断标志物,开发更具针对性的分子检测方法,并追踪病原在不同养殖区域和不同时间的遗传变化,为开展大黄鱼锥体虫病精准监测、传播风险研判和风险评估提供依据。同时,与宿主适应、免疫逃逸等相关的候选基因,也为寻找药物作用靶点和研发防控技术提供了新的切入点。