中国农科院基因组所解码猪基因表达调控密码——分析6020份转录组数据建立新方法
中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队开发了家畜全基因组等位基因特异性表达分析新方法,解码猪基因表达调控密码,相关研究发表在Genome Biology上。团队分析了6020份猪转录组数据,覆盖34个品种、42种组织,发现猪基因组中存在超30万个等位基因特异性表达位点,为猪精准育种和功能基因组学研究提供数据支撑。
中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队开发了家畜全基因组等位基因特异性表达分析新方法,解码猪基因表达调控密码,相关研究发表在Genome Biology上。团队分析了6020份猪转录组数据,覆盖34个品种、42种组织,发现猪基因组中存在超30万个等位基因特异性表达位点,为猪精准育种和功能基因组学研究提供数据支撑。
近日中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队联合多家单位,成功构建了面向猪的轻量型基因组语言模型及多任务评测平台,实现对猪基因组功能区域的高效精准预测。采用'突变优先学习'策略,模型在多项任务上的性能接近甚至超过部分超大参数模型。
中国农科院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队成功构建面向猪的轻量型基因组语言模型及多任务评测平台,创新采用"突变优先学习"策略,在多项任务上性能接近甚至超过部分超大参数模型,为猪功能基因组学研究提供低成本、高效率工具。该研究得到生物育种国家科技重大专项、国家自然科学基金等项目资助,成果发表于《生物信息学简报》(Briefings in Bioinformatics)。