#T2T基因组

8月13日《Horticulture Research》在线发表了河北省农林科学院田静研究员、范保杰研究员团队完成的题为「A Gapless T2T Genome and Population-Scale Resequencing of Adzuki Bean Reveal Centromere Evolution and Accelerate Molecular Breeding」的研究论文。该研究以「冀红16」为材料，组装了首个小豆无缺口端粒到端粒(T2T)参考基因组(JH16-T2T)，基因组总大小514.85 Mb，Contig N50达48.72 Mb，BUSCO完整性达98.8%，QV值44.19；首次完整解析了11条染色体的全部端粒和着丝粒区域。对706份全球小豆种质进行全基因组重测序，共鉴定到101.5万个高质量SNP，将种质划分为中国南方群、中国北方群和海外群3大类群，筛选出112份核心种质。在39个重要农艺性状GWAS中共鉴定到9613个非冗余标记-性状关联位点；首次在小豆中建立基因组选择育种体系，GBLUP模型预测准确率最高，仅使用500~1000个GWAS标记即可对百粒重、开花期、株高等性状达到0.8以上预测准确率。

上海市农业科学院花菜生物育种团队在西蓝花基因组学与品质形成机制研究方面取得重要进展:研究团队成功构建了国际上首个西蓝花T2T无缺口全基因组,解析了调控花蕾在低温下显现紫色及花青素积累的关键基因BoF3'H,相关研究成果发表于国际SCI一区园艺学界顶级学术期刊《园艺研究》(Horticulture Research)。日本百年种业巨头坂田种苗优质品种"耐寒优秀"长期基本垄断全球,种子价格一度被炒到每公斤3万元。市农科院育成的中国第一个西蓝花品种"上海一号"和能与进口欧美品种相抗衡的杂交品种"沪绿五号"实现了对欧美等国西蓝花育种的赶超。