中国农科院蔬菜花卉所 Nature Genetics 揭示黄瓜"走遍全球"基因秘密:125 份基因组构建迄今最大黄瓜泛基因组
研究组装 125 份黄瓜高质量基因组,构建迄今规模最大、质量最高的黄瓜泛基因组。系统刻画结构变异与基因拷贝数变异的全貌,发现 CsFT 串联重复变异是驱动黄瓜早花适应的遗传基础,并首次克隆了参考基因组中已"隐性丢失"的黑星病抗性基因 CsCcu。
花卉产业、月季等观赏园艺
研究组装 125 份黄瓜高质量基因组,构建迄今规模最大、质量最高的黄瓜泛基因组。系统刻画结构变异与基因拷贝数变异的全貌,发现 CsFT 串联重复变异是驱动黄瓜早花适应的遗传基础,并首次克隆了参考基因组中已"隐性丢失"的黑星病抗性基因 CsCcu。
近日,云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所受邀参加由云南省商务厅联合南亚东南亚七国驻昆明总领事馆共同主办的'共享大市场•出口中国'系列活动,并发布3项核心农业科研成果。葡萄产业绿色发展及标准化体系构建成果聚焦葡萄全产业链绿色生产管控关键环节,搭建起科学完善的葡萄产业标准体系;中国猕猴桃品质评价技术研究建立起一套科学可行的果蔬品质评价技术体系,可为澜湄区域各类特色果蔬品质评定提供标准化参考依据;花卉智能检测技术成果及颜色图像分析系统解决了传统花卉育种与检测长期依赖育种家肉眼主观判定花色、精准度不足、难以标准化、无法实现数据化积累等弊端,实现了花卉颜色的定量、定性精准分析。此次发布的3项科研成果精准对接产业需求与跨境贸易痛点,全方位覆盖果蔬种植管控、品质评定、花卉智能检测全链条,为澜湄区域农业产业协同发展筑牢技术根基。
江苏省农科院休闲所花卉团队在国际知名期刊《Plant Cell Reports》(JCR1区,五年影响因子6.1)发表绣球叶斑病抗性调控研究论文。研究人员基于绣球基因组数据鉴定获得164个AP2/ERF家族基因,通过对抗病、感病品种在多主棒孢菌侵染前后的转录组分析筛选得到46个病原菌响应型HmaERF基因,并利用瞬时基因功能验证成功挖掘出绣球叶斑病抗性的正调控子HmaERF87。本研究首次系统解析绣球AP2/ERF转录因子家族并鉴定关键抗病基因,丰富绣球抵御多主棒孢菌侵染的转录调控理论。
广东省农科院环艺所在《Industrial Crops and Products》发表研究,通过多组学解析揭示不同姜荷花品种感官香味分化形成的代谢基础与转录特征。WGCNA分析鉴定出两个与关键挥发性有机物显著相关的模块(Brown和Green),包含MEP途径结构基因、萜类合成酶、氨基酸与脂肪酸代谢、酯类合成及ABC转运蛋白等相关基因,均在Snow中高表达;相关性网络分析提示MYB、NAC、bHLH和ERF等转录因子可能参与调控。浓香型姜荷花种质Snow及其特征挥发性有机化合物可为培育多性状聚合新品种及精油纯露等功能性产品开发提供宝贵资源。研究获得广州市科技计划项目、广东省农科院金颖人才项目、国家自然科学基金青年基金等资助。
中国农科院蔬菜花卉研究所分子设计育种团队建立了一套辣椒高效遗传转化体系,突破了辣椒再生效率低、转化效率低、筛选难度大等技术瓶颈,利用CRISPR/Cas9技术实现靶向基因编辑。相关成果以An Efficient Spectinomycin and Visual Marker-based Genetic Transformation System and Gene Editing in Pepper为题发表在《园艺研究(Horticulture Research)》。芽诱导率约80%、芽伸长率提升至50%;转基因阳性率由约1%提升至8%以上。
国家大宗蔬菜产业技术体系花卉植保技术岗联合多位花卉技术岗站科学家组成调研团队,8月10日至12日深入云南昆明、玉溪、晋宁等花卉主产区开展花卉产业全链条闭环式调研。调研团队先后走访中国科学院昆明植物园、国家观赏园艺工程技术研究中心、国际花卉技术创新中心、昆明国际花卉拍卖交易中心、云南农业科技园、云南省农科院花卉所宝峰基地、大春河基地及多家龙头企业和种植基地。针对切花月季在高温高湿环境下病害频发、花期品质波动等行业痛点,集成环境精准调控与生物防治方案。
中国农业科学院蔬菜花卉研究所组装 125 份黄瓜高质量基因组,构建迄今规模最大、质量最高的黄瓜泛基因组,系统刻画结构变异与基因拷贝数变异的全貌。研究发现 CsFT 串联重复变异是驱动黄瓜早花适应的遗传基础,并首次克隆了参考基因组中已'隐性丢失'的黑星病抗性基因 CsCcu 和受稀有变异调控的果长基因 CsSPL1。论文发表于《自然·遗传学》(Nature Genetics)。
环艺所通过 WGCNA 分析鉴定出与姜荷花关键挥发性有机物显著相关的 Brown 模块和 Green 模块,发现 MEP 途径结构基因、萜类合成酶、氨基酸与脂肪酸代谢、酯类合成及 ABC 转运蛋白相关基因均在 'Snow' 中高表达,相关网络分析提示 MYB、NAC、bHLH、ERF 等转录因子可能参与调控。
云南省农科院所在晋宁区200亩花圃,月季育种专家李淑斌博士带领团队坚守十余年,致力于为月季装上'中国芯'。面对国内超90%月季品种依赖进口的困境,团队申报自主知识产权新品种295个,2024年育种规模突破100万粒。通过建立'产研小院'模式,实现年产值超1亿元,带动乡村振兴。李淑斌从2002年大学毕业进入云南省农科院园艺所花卉成果转化中心工作,2015年学成归国后创建市场化育种团队,在昆明市晋宁区宝峰街道的山沟里辟出7亩贫瘠山地开展育种试验。团队保存育种材料超30万份,获批'农业农村部月季育种重点实验室'。
8月4日,广东省农作物品种审定委员会办公室组织专家在广东省农业科学院环艺所白云基地召开姜荷花新品种鉴定会,鉴定'金颖橙粉'、'金颖流云'、'金颖粉晶'3个姜荷花新品种,均通过现场鉴定,'金颖橙粉'属粉橙色切花品种,'金颖流云'属香槟色切花品种,'金颖粉晶'属浅粉色切花品种,均具有较好的市场开发前景。同期,基因中心科技赋能五指毛桃产业助力'韶河龙'粤闽共富机制,提出构建'韶关+河源+龙岩'苏区老区生态农业产业共同体,提议筹建五指毛桃研究院、发布'中华五指毛桃指数'、共建五指毛桃种质资源圃、攻关发酵饲料与高端制品。
农民日报8月11日报道:中亚花卉产业园落地新疆昌吉州呼图壁县,园区建成后将提供518个长期稳定岗位,本地农户用工比例不低于70%,种苗管护、鲜花采收、包装运维等岗位就近吸纳村民务工。参照云南成熟产业数据,花卉种植亩年产值可达5万至10万元,远超传统果蔬。园区联动本地日光温室发展配套配花种植,呼图壁县依托'西部苗都'产业底子,推动本地花卉产业从苗木中转向产地直出口转型,延伸面向中亚的农业外贸产业链。
中国农科院蔬菜花卉所牵头联合青岛农业大学及国内外多所高校,完成三大核心成果:建成全球规模最大、质量最优的黄瓜泛基因组公共资源,填补黄瓜完整遗传变异数据库空白;成功克隆CsFT、CsCcu、CsSPL1三大具备极高育种价值的功能基因,可快速开发配套分子标记,直接应用于早熟、抗病、优质果型黄瓜新品种定向选育;建立'高质量泛基因组构建+亚群体分层关联分析+基因编辑功能验证'的完整标准化研究流程。中国科学院院士钱前评价,该研究打通基因组结构变异与农艺性状的关联通路,挖掘抗病、果长关键功能基因,为黄瓜精准分子育种筑牢基础。
中国农科院蔬菜花卉研究所张圣平研究员团队联合青岛农业大学在国际期刊《自然·遗传学》发表论文,建成当前规模最大、组装质量最优的黄瓜染色体级泛基因组。整合全球422份黄瓜种质重测序数据,筛选125份代表性材料完成染色体水平基因组组装,新增28890个此前从未被报道的非冗余新基因。依据全基因组SNP标记将全球黄瓜划分为印度、西双版纳、欧亚、东亚四大地理类群,系统解析结构变异调控黄瓜地域适应与农艺性状分化的遗传机制,成功克隆黑星病抗性基因CsCcu与果长调控基因CsSPL1,为我国蔬菜种业自主创新提供核心理论支撑与可复制技术范式。
近日,山东省农业科学院在两个领域取得重要进展。农产品加工与营养研究所果蔬加工与贮藏团队在食品领域国际期刊Food Research International(中科院1区TOP,IF=8.8)发表题为Complex Enzymolysis-Derived Peanut Peptides: In Silico Selection of Antioxidant Peptides and Their Delivery System的论文,基于复合酶解花生肽,运用AI虚拟筛选构建抗氧化肽筛选与递送体系,显著提升花生肽的抗氧化活性与生物利用度,为花生蛋白高值化利用提供新策略。休闲农业所花卉育种与栽培团队选育的月季新品种鹊华绯茜获国家林业和草原局2026年第一批植物新品种权授权,成为本次名单中山东省唯一获批的月季新品种,标志山东月季自主育种创新取得新突破。